1.税务清算
存货处理：
企业注销时，存货需要妥善处理。如果存货分配给股东或投资者，应视同销售，按照存货的公允价值缴纳增值税。例如，企业注销时有价值 10 万元的存货，市场公允价值也是 10 万元，若将其分配给股东，就需要按照适用税率（一般纳税人销售货物可能是 13%）缴纳增值税 1.3 万元。
若存货因过期、变质等原因报废，需要进行进项税额转出处理。例如，企业注销时有一批原材料因过期报废，其购进时的进项税额为 1 万元，在注销税务清算时，需要将这 1 万元进项税额转出，增加企业的应纳税额。
固定资产处置：
企业注销时固定资产的处置同样涉及税务问题。如果固定资产销售，一般纳税人需要按照销售自己使用过的固定资产政策缴纳增值税。例如，企业销售一台使用过的设备，售价为 5 万元，购进时未抵扣进项税额，按照简易办法依照 3% 征收率减按 2% 征收增值税，应缴纳增值税 50000÷(1 + 3%)×2%≈970.87 元。
若固定资产发生损失，需要提供相关证明材料，如固定资产的报废、毁损证明等，经税务机关核准后，可以在企业所得税前扣除损失。
往来账款清理：
对于应收账款，如果确实无法收回，形成坏账损失，需要按照企业所得税法规定的条件进行确认。企业需要提供相关证明材料，如债务方破产证明、注销证明等，在企业所得税前扣除坏账损失。例如，企业有一笔 10 万元的应收账款无法收回，经过一系列法定程序确认后，可在计算企业所得税时减少应纳税所得额 10 万元。
应付账款方面，如果企业确实无法支付的应付款项，应计入企业的其他收入，缴纳企业所得税。例如，企业注销时有 5 万元无法支付的应付账款，这 5 万元需要计入应纳税所得额，按照 25% 的税率缴纳企业所得税 1.25 万元。
2.未申报税款
有些企业在经营过程中可能存在未申报的税款，如漏报增值税、企业所得税等。在注销税务登记时，税务机关会对企业的纳税情况进行全面检查。一旦发现未申报税款，企业需要补缴税款，并且可能会面临罚款和滞纳金。例如，企业漏报了一个季度的增值税销售额 100 万元，假设适用税率为 13%，需要补缴增值税 13 万元，同时还可能会根据税收征管法规定，按日加收万分之五的滞纳金，罚款金额则根据具体的违法情节确定。
3.税收优惠政策的后续处理
企业如果在注销前享受了税收优惠政策，如研发费用加计扣除、小型微利企业所得税优惠等，需要检查是否符合政策的后续要求。例如，企业享受了研发费用加计扣除政策，但在注销时发现研发项目的相关资料不完整，税务机关可能会要求企业对已享受的加计扣除金额进行调整，补缴相应的企业所得税。
4.税务注销程序的合规性